显微镜的数字图像，图像分辨率的质量，是确定的像素，每个像素的亮度值范围内的总人数。图像分辨率是衡量数字图像在何种程度上代表显微镜记录的模拟图像的细节。预留的空间分辨率来形容的利用，在建设和数字图像渲染的像素数量。根据精细的图像进行采样在数字化与高空间分辨率图像在相同的物理图像尺寸更大的像素数量，这个数量是依赖。因此，增加数字图像的采样和量化期间获得的像素数，图像的空间分辨率也随之增加。 最佳的采样频率，或用来建立一个数字图像的像素数，确定匹配分辨率成像设备和计算机系统，用于可视化图像。应产生足够数量的像素采样和量化，以可靠地代表原始图像。当充分采样，模拟图像的细节可以被丢失或模糊。