1.真细菌门Eubacteria和古细菌门Archaebacteria的成员是原核细胞(DNA或RNA直接溷在细胞质裡，没有被「核膜」包覆、分隔开来)。 2.把有机体分门别类的一种方法是分析细胞的种类。各式各样的细菌与其他种类生物最基本的差异是：细菌都是原核细胞，可是其他种类的有机体细胞都是真核细胞(DNA被核膜包覆保护)。 3.分子比较所提供的数据显示，细菌其实可分为两类：真细菌门Eubacteria和古细菌门Archaebacteria；虽然它们都隶属于原核生物界，但是彼此的关係是很遥远的。 4.透过分子比较，我们发现原核生物界其实可分为二类：真细菌门Eubacteria和古细菌门Archaebacteria。这二门生物被认为是来自于同一祖先细胞，在演化史非常早期阶段就分裂演化成二个物种。 5.原核族群的分类准则是，分辨这些有机体的阶层以及它们摄取营养的模式。 6.对原核单细胞有机体分类，会遇到的一个大问题。单细胞原核生物unicellular eucaryotes，传统上被动物学家称为原生动物pratozoans，它就是一个分类上的麻烦，尤其是那些有鞭毛flagellate的原生动物。