首先

生命科学应用较多的生物显微镜和金像显微镜的（金相显微镜多是用于鉴定和分析金属内部结构分析，是研究金属属相的的仪器，一般多是工业部门鉴定产品质量设备，该金像显微镜配合摄像装备，便可拍摄金相图谱，然后研究人员可以对图谱进行研究分析）
不同点：
他们之间的不同是照明和物镜上的区别：

一、（1）生物显微镜一般观察透时和半透明的样本，所以用的是投射照明法，不可以观察不透明物体；落射照明法
（2）金相显微镜可以观察透明待测样本但主要观察不透明样本的表面属性，照明光是从物镜射出，使用的是

二、物镜的不同点：
（1）生物显微镜的高倍物镜都有考虑盖玻片厚度（0.17）和载玻片、培养器皿厚度（1.2），
所以其物镜是通常标有 /0.17（正置显微镜）、 /1.2（倒置显微镜），
正置生物显微镜10倍以下物镜则是 /-，也就是可以不考虑，这是为了校正玻璃对于光折射的影响，
（2）金相显微镜的物镜通常标有/0 。

生物显微镜为了解细胞的生长情况，经常需作显微镜观察，另外还可检查细胞是否发生污染

绝大数生物显微镜属于此类照明法；后者则适用于非透明的被检物体，光源来自上方，又称""反射式照明"