显微镜许多不同的品种在市场上，每一种显微镜都拥有特定的应用功能：

普通光学显微镜 - 采用一个镜头，弯曲的镜头，在放大过程中。这种类型的显微镜是由安东列文虎克17世纪发明的。

复合光学显微镜 - 光学，短焦距端到端客观的角度打算,生物显微镜。许多光学系统的工作，以减少色差以及球面像差，因此方面是清楚的,体视显微镜，不受影响的。

立体显微镜，它也被称为解剖显微镜，并采用两个独立的光学轴（双眼）产生一个三维图像。这种显微镜进行显微分析，手表，小电路板制造，等等。

倒置显微镜：这各种显微镜比常规显微镜倒置的位置。倒置显微镜专注于液体内的细胞培养的研究。

岩相显微镜：这一类显微镜的特点偏光过滤系统，一个旋转的立场，和石膏板。岩相显微镜集中在无机物质的研究，往往在不断变化的角度改变其属性。

袖珍显微镜：这种显微镜与这种旧式的显微镜相比较可以便携方便携带,偏光显微镜。