在过去的几十年中，荧光显微镜已成为一个研究生物分子，途径和在活细胞，组织和整体动物动力学的各种各样的必不可少的工具。相反）其他技术（如电子显微镜，荧光成像是与正在保持文化，使一个大跨度的时间尺度上发生的事件微创光学观察细胞兼容。在空间分辨率方面，包括正电子发射断层扫描，磁共振成像和光学相干断层扫描技术，可以产生动物和人类受试者在10厘米和10微米之间的决议的图像，而电子显微镜和扫描探针技术具有最高空间决议，往往接近分子和原子水平。这两个极端之间在解决权力在于光学显微镜。除了能够形象的活细胞，荧光显微镜的所有形式（包括广角，激光扫描，旋转盘，多光子，和全内反射的最显著的缺点）所带来的好处是空间分辨率的限制。