显微镜和图像投射到探测器表面是两维表示在三维空间中存在的对象。正如在第工一部分中讨论，图像被分成一个二维阵列的像素图形由X和Y轴代表。每个像素是一个典型的正方形区域的横向分辨率和放大倍率的显微镜以及探测器阵列的物理尺寸决定。类似的像素在2D成像，量元素或像素，定义X，Y，Z轴的尺寸，是在三维成像的基本单位或抽样量。

长期多维成像可以用来描述三维成像（3D体积），四维成像技术（4D;数量和时间），或在5个或更多维成像（5D，6D等，数量，时间，波长），分别代表不同的变量组合。

现代生物科技的应用越来越需要光学仪器和数字图像处理系统，能够捕捉定量，多维信息有关动态，空间复杂的标本。